La fundación APNA nació en 1976, ante la inquietud de un grupo de padres de niños autistas, para darle a sus hijos un espacio que reuniera la calidez de una hogar y la eficiencia de un servicio educativo terapéutico. Fue declarada Entidad de Bien Público a nivel nacional.

En 1977 inició sus actividades como Hospital de Día en Capital Federal. Cinco años después inauguró su sede actual en el corazón de Palermo.

En 1987 se inició la construcción de un Centro Educativo-Terapeutico en la localidad de Ing. Maschwitz, Provincia de Buenos Aires.

En 1988 fue declarada Entidad de Bien Público por el Municipio de Escobar, partido al que pertenece.

En 1992 se inauguró en la sede de Palermo, el Hogar donde los jóvenes completan la jornada diaria en un clima de convivencia familiar.